Η προστασία του φυσικού περιβάλλοντος και η εξυγίανση των υποβαθμισμένων από την ανθρώπινη δραστηριότητα περιοχών, αποτελεί ένα από τους κεντρικούς ερευνητικούς στόχους σε παγκόσμιο αλλά και ευρωπαϊκό επίπεδο. Οι βιοτεχνολογικές εφαρμογές των φυτών στην προστασία του περιβάλλοντος αναπτύσσονται τα τελευταία χρόνια σε δύο κυρίως κατευθύνσεις. Η πρώτη περιλαμβάνει την πρόληψη της ρύπανσης, κυρίως μέσω της μείωσης των αγροχημικών που απαιτούνται για την καλλιέργεια τους. Η δεύτερη προσέγγιση περιλαμβάνει την χρησιμοποίηση φυτών για την αποδόμηση των ρύπων από τα υποβαθμισμένα οικοσυστήματα (Φυτοεξυγίανση-Phytoremediation). Πέρα από τα προφανή άμεσα περιβαλλοντικά οφέλη, η ανάπτυξη βιοτεχνολογικών μεθόδων για την εξυγίανση περιβαλλοντικά υποβαθμισμένων περιοχών μπορεί να συμβάλει και στην αύξηση της γεωργικής παραγωγής, καθώς μεγάλες εκτάσεις μολυσμένων περιοχών θα μπορούσαν να αποδοθούν με ασφάλεια στην καλλιέργεια.